蛋白質組學（Protemics）一詞，源于蛋白質（Protein）與基因組學（Genmomics）兩個詞的組合，意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的疾病發生、細胞代謝等過程的整體而全面的認識。

蛋白質組學研究不僅是探索生命奧秘的必須工作，也為人類健康事來作出巨大貢獻。